Uppdaterades 5 juni 2022 kl. 20:07
Fall 9: Cytoskelettet
En medelålders man förlorar ofrivilligt vikt och upptäcker blod i avföringen. Det visar sig att han har cancer i tjocktarmen.
Centralt innehåll
- Redogöra för olika mekanismer som kan leda till att en cell omvandlas till cancercell, samt ytterligare molekylära förändringar som bidrar till cancercellens förmåga att ge upphov till metastaser
- Beskriva hur proteinfilament påverkar cellens form, samt förklara hur filamentens strukturella och funktionella egenskaper bidrar till både intracellulära processer och cellens migration samt dess receptormedierade interaktioner med sin omgivning
- Beskriva sammansättningen av den extracellulära matrisen samt förklara hur denna understöder olika vävnaders styrka och elasticitet
Relevant material
Osmosis
Youtube
Finns många bra youtube-videor med animationer som visar ex. polymerisering av cytoskelettet! Här är en:
🔑 Nyckelkoncept
[su_spoiler title="Mikrotubuli
- uppbyggnad/syntetisering?
- var hittar man mikrotubuli i cellen?
- vad har dess filament för egenskaper?
- transport via mikrotubuli samt reglering?
" open="no" icon="chevron" style="default"]
- Ett filament består av alfa- och beta-enheter (GTP-GDP) som varvas.
- Centriol i centrosom är 9 st filament bestående av 3 sammantvinnade rör bestående av polymeriserade alfa- och beta-enheter i en rörstruktur.
- Mikrotubuli återfinns framförallt i cellens mitotiska spole / centrosom.
- Typer av mikrotubuli i mitotisk spole
- Astral
- Interpolar
- Kinetochore
- Typer av mikrotubuli i mitotisk spole
- Mikrotubuli har en negativt och en positivt laddad ände.
- Positiva kan snabbt byggas upp medan negativ = långsam.
- Positiva riktad ut mot cellmembran, negativ = inåt / mot centrosom.
- Till mikrotubuliände kan en "GTP-cap" tillföras vilket ger stabilitet.
- Transport
- Två olika motorprotein av vesiklar längs mikrotubuli. Dessa "fötter" som förskjuts framåt mha ATP-aktivering.
- Kinesin (+ ände/utåt)
- Dynein (- ände/inåt)
- Det som reglerar riktningen av transporten av vesikel är exempelvis:
- Mängden kinesin kontra dynein
- Fosforylering
- Reglerande protein som TAU (kinesin) och MAP2
- Två olika motorprotein av vesiklar längs mikrotubuli. Dessa "fötter" som förskjuts framåt mha ATP-aktivering.
[/su_spoiler]
[su_spoiler title="Intermediärfilament
- uppbyggnad/syntetisering?
- olika typer av IF samt funktioner?
- vad tillför IF till cellen?
" open="no" icon="chevron" style="default"]
- Två alfa-helixar (proteiner) sammanvävs via coil-coilformation mha hydrofoba interaktioner. Sedan vävs flertalet av dessa samman till protofibriller. Flera protofibriller ger sedan komplett intermediärfilament.
- Olika typer av IF
- Keratin - ankrar i desmosomjunctions.
- Lamin - stadgar cellkärnan.
- Desmin - "klister" i cellen.
- IF ger mekanisk hållfasthet och stabilitet hos cellen.
- Även kopplat till desmosomer (cadherin) och hemidesmosomer (integrin).
[/su_spoiler]
[su_spoiler title="Aktin och rörelse
- uppbyggnad/syntetisering och reglering?
- vilka proteiner reglerar aktinpolymerisation?
- treadmilling?
- från att en cellytereceptor binder kemotaxin till rörelse?
" open="no" icon="chevron" style="default"]
- G-aktinmonomerer med ATP inbundet kan binda in i +ände av nukleus (3-4 st monomerer som bundit in till varann) och ge upphov till spontan aktinpolymerisation. Två långa G-aktinpolymerer sammantvinnas vilket ger F-aktinfilament.
- När en G-aktinmonomer bundit in till polymer så har den en ökad sannolikhet att hydrolysera (ATP -> ADP) => depolymerisering / nedbrytning i -ände.
- Cofilin kan initiera hydrolys.
- Reglering av mängden aktin i cellen sker via feed-back-reglering:
- Lite aktin -> transkriptionsfaktorer för aktin stimuleras -> fler aktinmonomerer syntetiseras.
- Aktörer vid aktinpolymerisation
- Capping protein kan hämma fortsatt polymerisation.
- Cofilin bryter ner aktinkedjor.
- Tymosin binder till aktinetmonomerer vilket hämmar spontan polymerisation, framförallt av den nyss depolymeriserade +ändan.
- Profilin särar aktin från tymosin.
- Arp2/3 är som en ring som möjliggör förgrenad nysyntetisering av aktin.
- Treadmilling är när cellen depolymeriserar aktin i dess -ände (aktin-ADP) och polyermiserar i +ände (aktin-ATP) simultant.
- Det behövs en intermediär koncentration av aktin i cellen för treadmilling, denna depå tas- och byggs av ständigt.
- Treadmilling är effektivt pga att cellen kan kvickt omorganisera dess filament för ex. rörelse.
- Från kemotaxin till riktad rörelse
- G-coupled protein receptor (GCPR) binder in kemotaxin extracellulärt
- Signaleringskedja intracellulärt
- PIP3 rekryterar Rac2 till främre del av cell
- Rac2 kan öka aktinpolymeriseringen via
- Filopodier - dikterar Formin som ger rak polymerisation av aktinkedja.
- Lamellipodier - dikterar Arp2/3-komplexet som ger förgrenad polymersiation.
- Rörelsestroke ges via Myosin som använder sig av ATP för att orsaka rörelse hos aktin.
- Kalcium binder in till troponin som gör att tropomyosin möjliggör inbinding mellan myosin och aktin.
[/su_spoiler]
[su_spoiler title="Extracellulär matrix
- basalmembranet?
- kollagens syntetisering?
- grundsubstans?
" open="no" icon="chevron" style="default"]
- Basalmembranet är det som epitel/endotelceller är förandkrade i, finns alltså mellan yttersta cellager och ECM. Består av
- Lamininer (glykoproteiner), ska inte förväxlas med lamin (typ av IF).
- Perlecan (proteoglykan)
- Nidogen (glykoprotein
- IV kollagen
- trippelhelix som kräver C-vitamin för syntetisering, C-vitaminbrist = sjöbjugg.
- ECM består till stor del GAGs = glykosaminoglykaner som ger en gel-lik och mindre skör struktur som bättre kan stå emot ex. tryckpåfrestningar.
- Hyaluronsyra
- består av GAGs som inte är sulfaterade (till skillnad från proteoglykaners GAGs). De utgör en lång stomme som proteoglykanerna kan binda till.
- Proteoglykaner
- har långa GAGs påsatta på aminosyran serin.
- Dessa GAGs är starkt fosforylerade vilket gör dem negativa -> binder in Na+ samt vatten.
- har långa GAGs påsatta på aminosyran serin.
- Adhesiva proteiner
- Ex. fibronektin.
- Hyaluronsyra
[/su_spoiler]
[su_spoiler title="EMT / Epitel-mesenkymal transition
- vad är EMT?
- hur kan EMT uppstå?
" open="no" icon="chevron" style="default"]
- EMT är när en cell i epitelet förgår dess ursprungliga funktion (speglad i struktur) genom att ex. nedreglera vissa typer av junctionproteiner.
- EMT kan exempelvis uppstå då en celler förlorar dess polaritet eller fäste till omkringliggande strukturer, detta kan ske via nedreglering av junctionproteiner pga DNA-skada.
- Tight-junctions
- Occludin / Claudin
- Förlorar apikal-basolateral-polaritet.
- E-cadheriner
- Förlorar förankring till angränsande celler och kan då migrera i vävnaden.
- Tight-junctions
[/su_spoiler]